Công đoàn cơ sở Bệnh viện Bạc Liêu được thành lập từ năm 1977 trước đây trực thuộc Liên đoàn lao động tỉnh Bạc Liêu, sau đó công đoàn ngành y tế được thành lập năm 1997 Công đoàn cơ sở BVBL trực thuộc công đoàn ngành y tế, hoạt động dưới sự chỉ đạo trực tiếp của Đảng uỷ BVBL.
Các chủ tịch Công đoàn cơ sở trong những nhiệm kỳ qua:
Nhiệm kỳ 1988 – 1994: BS. Trần Lệ Minh Nhiệm kỳ 1994 – 1997: BS. Tô Kim Hồng Nhiệm kỳ 1997 – 2005: BS. Trần Văn Khánh Nhiệm kỳ 2005 – 2009: BS. Mã Quốc Thiện
Nhiệm kỳ 2009 – 2012: BS. Nguyễn Chí Thanh ( đi học) BS. Hồng Thị Phương Lan
Cùng với sự phát triển của khoa học kỹ thuật, BVBL có tầm vóc ngày càng lớn thì số lượng công đoàn viên ngày càng phát triển, tính đến cuối năm 2010 CĐCS đã có tới 768 công đoàn viên hoạt động ở 24 công đoàn bộ phận đạt tỷ lệ 100% CCVC tham gia công đoàn.
BCH Công đoàn cơ sở gồm có 15 đồng chí, ban thường vụ có 5 đ/c, 03 đ/c đi học dài hạn còn lại 12 trong đó có 4 nữ. Đồng chí Chủ tịch đi học dài hạn nên đ/c Phó chủ tịch tạm thời giữa quyền điều hành CĐCS.
Các thành tích đã đạt được trong những năm qua:
CĐCS vững mạnh xuất sắc 15 năm liền - được Tổng LĐLĐ Việt Nam tặng 5 cờ thi đua xuất sắc.
Bằng khen Thủ tướng chính phủ năm 2003.
Đạt giải nhất toàn đoàn hội thi văn nghệ toàn quốc ngành y tế năm 2009.
Tổng kết phong trào điển hình tiên tiến 5 năm 2005-2010 CĐCS BVBL và Ban Nữ công CĐCS BVBL có thành tích xuất sắc được Uỷ ban Tỉnh tặng bằng khen.